حوزه ریاست و دبیرکل

 به عنوان محور اصلی تصمیم گیری و هماهنگی، نقشی راهبردی در جهت دهی و هدایت فعالیت های کمیسیون بر عهده دارد. این حوزه با ساماندهی و هم افزایی میان معاونت ها و ادارات تخصصی، بستر انسجام درون سازمانی را فراهم ساخته و از این طریق زمینه اجرای منسجم و مؤثر برنامه های کمیسیون را فراهم می کند.مدیریت این حوزه مستقیم اً بر عهده دبیرکل کمیسیون ملی یونسکو در ایران است. دبیرکل ضمن تقسیم وظایف و مأموریت های محوله میان بخش های مختلف، نظارت مستمر بر حسن اجرای آن ها را اعمال نموده و با اتخاذ رویکردی برنامه محور، راهبردها و سیاست های اجرایی لازم برای پیشبرد فعالیت های جاری و آینده کمیسیون را تدوین می نماید. به این ترتیب، حوزه ریاست و دبیرکل نه تنها در سطح مدیریتی به تنظیم و هدایت امور می پردازد، بلکه با ایفای نقش راهبری، تضمین کننده تحقق اهداف کمیسیون در عرصه ملی و بین المللی است.

بخش‌های تخصصی:

این بخش‌ها که مطابق با پنج زمینه اصلی فعالیت یونسکو تشکیل شده‌ عبارت است از: گروه آموزش، گروه علوم طبیعی، گروه علوم اجتماعی و انسانی، گروه فرهنگ و گروه ارتباطات و اطلاعات. بخش‌های برنامه‌ای برای پیشبرد فعالیت‌های یونسکو در کشور دارای کمیته‌های ملی تخصصی‌اند که اعضای آنها مرکب‌ از نخبگان کشور در حوزه‌های مختلف تخصصی است.

• هر یک از گروه‌ها یا اداره‌های تخصصی کمیسیون، دارای کمیته‌‌های تخصصی متشکل از نمایندگان مؤسسات و سازمان‌های دولتی ذی‌ربط و متخصصان دانشگاهی و صاحب‌نظران می‌باشد. ارتباط این کمیته‌ها با یونسکو و مؤسسات تابعه آن از طریق دبیرخانه کمیسیون ملی انجام می‌شود.
• اعضای کمیته‌های تخصصی با پیشنهاد دبیرکل و حکم وزیر علوم، تحقیقات و فناوری برای مدت دو سال منصوب می‌شوند.
• رئیس هر گروه یا اداره تخصصی کمیسیون به‌عنوان دبیر و نماینده کمیسیون ملی با داشتن حق رأی در کمیته‌های تخصصی ذی‌ربط شرکت می‌کند.
• هریک از کمیته‌های تخصصی شرح وظایف خود را تدوین و برای تصویب به شورای اجرایی کمیسیون پیشنهاد می‌نماید.

بخش پشتیبانی:

شامل امور مالی و اداری، واحد فناوری اطلاعات و تدارکات است.

بخش خدماتی:

این بخش در بردارنده کتابخانه و مرکز اسناد، انتشارات و روابط عمومی است.